Étiquette : Services aux chercheurs

Doctorants Université de Paris – cycle de formation à la Science ouverte

Auteur biusantePublié le

Les doctorants et les chercheurs sont de plus en plus fortement incités à faire évoluer leur façon de faire de la recherche, afin de pratiquer une science dite « ouverte ».

A travers la publication en open access, l’ouverture, le partage des données de la recherche et des protocoles scientifiques, la Science ouverte se présente comme un ensemble de pratiques visant à faciliter la diffusion et la réutilisation des résultats de la recherche, afin d’augmenter sa qualité et sa transparence. L’ensemble de ces thématiques se pose au cours de chaque projet de recherche, à commencer par la thèse de doctorat.

Le cycle de formation à la Science ouverte est accessible à tous les doctorants d’Université de Paris. Le suivi du webinaire introductif est très fortement recommandé avant de s’inscrire aux autres modules. Une fois inscrit à ce webinaire, un doctorant peut choisir de suivre tous les modules ou seulement quelques-uns.

1/ Science ouverte : Webinaire introductif

La formation vise à présenter un large panorama de ce que recouvre la notion de « Science ouverte ».

S’incrire à une session (en visioconférence) :

2 et 3/ Science ouverte : publications scientifiques 

Cette formation se divise en deux modules :

Stratégies de publication

Cette formation se veut une initiation aux mécanismes de l’édition scientifique, aux stratégies de publication et de diffusion et aux critères de sélection de revues en open access.

S’inscrire à une session : Jeudi 05 novembre 2020 de 09:30 à 12:30

Appréhender et optimiser l’impact de ses publications

Avec la montée en puissance de la Science ouverte, les données accessibles s’enrichissent et se multiplient. Dans ce contexte, optimiser l’impact de ses publications est primordial pour un chercheur. Il est devenu indispensable de s’interroger sur la qualité des sources et des supports de publication, sur la visibilité, l’impact et l’accessibilité des données bibliographiques générées

S’inscrire à une session : Jeudi 05 novembre 2020 de 14:00 à 17:00

4 et 5/ Science ouverte : données de recherche

Cette formation se divise en deux modules :

Gérer ses données de la recherche : quel intérêt pour un jeune chercheur ?

Dans l’écosystème actuel de la recherche scientifique, un chercheur se distingue autant par la qualité de son travail que par la visibilité qu’il parvient à lui donner. Ces deux aspects dépendent notamment du soin accordé à la gestion et à la préservation de ses données de recherche, sur lesquelles reposent ses projets présents et futurs, ainsi que ses publications.

S’inscrire à une session : Mardi 10 novembre 2020 de 09:30 à 12:30

Concevoir un plan de gestion de données : attendus et réalisation

Après une introduction sur la gestion des données de recherche dans un contexte de Science ouverte, l’intérêt des plans de gestion de données et les attendus des financeurs, cette formation s’organise en deux parties : description des attendus d’un plan de gestion de données, puis atelier pratique de réalisation d’un plan de gestion.

S’inscrire à une session : Mardi 10 novembre 2020 de 14:00 à 17:00

6/ Conjuguer sa stratégie de présence en ligne avec les pratiques de la Science ouverte

La valorisation des activités de recherche passe entre autres par les différents outils numériques et réseaux sociaux. Cette formation a pour objectif de vous permettre d’évaluer votre présence numérique et de mettre en place des stratégies pour gérer votre identité numérique afin d’être lu, vu, trouvé, connu.

S’inscrire à une session : Jeudi 12 novembre 2020 de 09:30 à 12:30

7/ Science ouverte : atelier HAL

Le dépôt dans HAL permet de mettre en accès libre ses publications de niveau recherche pour en augmenter la visibilité et l’impact. Cette formation propose d’accompagner les doctorants dans la démarche de dépôt, et de contribuer ainsi à la visibilité de leurs travaux.

S’inscrire à une session : Jeudi 12 novembre 2020 de 14:00 à 17:00

Nouveau Pubmed : ce qu’il faut savoir

Auteur biusantePublié le

Peut-être certains et certaines d’entre vous ont pu le découvrir dès septembre 2019, ou encore avant sous le nom de Pubmed Labs : depuis mai dernier, Pubmed, le principal moteur de recherche en sciences biomédicales produite par la National Library of Medicine (NLM), s’est dotée d’une nouvelle interface et a fait évoluer plusieurs de ses fonctionnalités.

Nous présenterons ici les évolutions les plus significatives de la base de données. Toute l’équipe de la BIU Santé est par ailleurs sur le pont pour produire un tutoriel complet[1].

Une nouvelle interface

L’essentiel des modifications ont concerné l’interface de navigation de Pubmed :

  • La nouvelle interface de la base de données s’adapte automatiquement sur smartphone, tablette ou ordinateur.
  • L’affichage des résultats s’est amélioré : les mots-clefs recherchés sont maintenant surlignés en gras dans les résultats.
  • Il est possible d’afficher jusque 200 résultats par page.
  • L’affichage des articles et la navigation entre ceux-ci sont facilitées : vous pouvez passer rapidement d’un article à un autre à l’aide des flèches situées à droite ou à gauche (ou avec les flèches Prev et Next situées en bas de l’écran sur smartphone), et l’onglet « Articles similaires » est plus facile d’accès.
  • Il vous est également plus facile de naviguer au sein de la présentation d’un article via le menu de la colonne de droite.
  • L’accès au texte intégral des articles qui vous sont accessibles vous est proposé en haut à droite des notices des articles, via l’option « Full text link ».
  • La majorité des options et en particulier des filtres disponibles sont toujours accessibles dans le menu à gauche de l’écran. Une nouvelle option vous permet d’afficher et d’exporter le nombre de résultats publiés par année pour votre recherche.

    Ventilation des résultats par année pour une recherche sur « Down syndrome »

Cette nouvelle interface offre également de nouvelles options de citations d’articles et d’export de références :

  • Depuis la page de recherche, vous pouvez sélectionner plusieurs résultats pour les exporter vers le clipboard où ils seront conservés pendant 8 heures (avec le bouton Send to) ou produire un fichier qui contienne ces références bibliographiques (avec le bouton Save). Attention toutefois, le format RIS n’est plus pris en charge : l’export dans un logiciel de gestion bibliographique nécessite de passer par le format Pubmed.
  • L’option Cite (accessible dès la page de recherche) vous permet de récupérer la référence bibliographique d’un article selon la norme de votre choix (AMA, APA, MLA ou NLM).

 

De nouvelles modalités de recherche

Le projet initial du nouveau Pubmed est de répliquer dans la base de données des modes de recherche auxquels ses utilisateurs et utilisatrices ont l’habitude sur d’autres sites, en particulier sur les moteurs de recherche généralistes. Cette volonté se traduit par l’adoption d’un algorithme de présentation des résultats, le « Best match », sélectionné par défaut dans l’interface du nouveau Pubmed. En lieu et place du précédent mode d’affichage des références les plus pertinentes, qui recherchait la fréquence d’utilisation d’un mot-clef dans un titre, un abstract ou un article, le Best match s’appuie sur tout un ensemble de données pour ordonner les références : année de parution de la référence, type de publication, langue, etc. Ainsi remontent en premier les résultats les plus récents ou disposant du plus haut niveau de preuve (revues systématiques et méta-analyses). L’algorithme se veut par ailleurs évolutif selon les usages des utilisateurs de Pubmed.

Le bouton « Display options » vous permet de revenir à d’autres modes d’affichage des résultats, notamment par date de publication.

Outre l’implémentation de cet algorithme, la NLM a fait évoluer le fonctionnement même de la recherche sur Pubmed avec l’Automatic Term Mapping ou ATM. Lorsque vous recherchez un terme sur Pubmed, le moteur de recherche va automatiquement raccorder ce terme au mot-clef Mesh qui lui correspond ainsi qu’à tout un ensemble de synonymes : il s’agit du mapping. Ainsi, une recherche avec « cancer » va automatiquement mener au mot-clef « neoplasms ». Dans le cadre du nouveau Pubmed, cette recherche est maintenue étendue :

  • à davantage de variations et de synonymes : « cancer » mène toujours à « neoplasms » mais aussi à « cancerization », « cancerous », « canceration », etc.
  • aux pluriels des termes recherchés : tooth comprend teeth.
  • aux équivalents anglais et américains d’un même mot : « labor pain » recherche également « labour pain ».

 

Interprétation de la recherche « cancer » sur l’ancien Pubmed (gauche) et le nouveau Pubmed (droite)

Les règles de troncature ont également évolué :

  • Il n’y a maintenant plus de limite au nombre de variations recherchées avec une troncature (contre 600 variations maximum auparavant).
  • La troncature peut être utilisée avec des guillemets pour chercher les différentes variantes d’une expression figée : ainsi, « « occupational therap* » » pour trouver « occupational therapy » et « occupational therapists », etc.
  • Attention, l’utilisation d’une troncature doit être précédée d’au moins quatre caractères pour être reconnue.

Enfin, la refonte de Pubmed a permis d’améliorer la recherche avancée. Les anciennes options sont toujours disponibles : vous pouvez composer votre recherche à partir de votre historique ou en rentrant des requêtes spécifiques.

Désormais, vous pouvez aussi corriger à la volée les équations de recherche que vous composez ou y insérer les références collectées dans le clipboard.

L’historique de la recherche avancée donne également accès aux « Search details » qui vous renseignent sur la manière dont Pubmed a interprété vos requêtes.

La nouvelle interface de recherche avancée de Pubmed

 

Pourtant, la nouvelle version de Pubmed n’est pas totalement satisfaisante

Certains aléas découlent de la mise en place d’un nouveau moteur de recherche : ainsi des surinterprétations de requête et des résultats incohérents. Par exemple, si « assistive technology » mène bien au mot-clef Mesh « self help devices », « assistive game » renvoie à « dental assistants AND game ».

Par ailleurs, il est plus difficile qu’auparavant de savoir comment Pubmed a interprété vos recherches. Le « Search details » s’affichait auparavant sur la page de recherche, il est maintenant uniquement accessible dans les options de recherche avancée.

Le moteur de recherche et le fonctionnement du mapping sont encore destinés à évoluer à l’avenir : si vous détectez des erreurs ou des interprétations abusives, vous pouvez contacter la NLM via le « Help Desk ».

L’évolution de la recherche sur Pubmed a d’autres conséquences plus problématiques. Du fait de l’évolution du mapping et de la prise en charge de la troncature, une même équation de recherche utilisée sur l’ancien et le nouveau Pubmed ne renvoie plus au même nombre de résultats ni aux mêmes références. Que la différence soit marginale ou importante (et elle peut l’être : une recherche sur « haemorrhage » renvoie respectivement de 400 000 à près de 5 millions de résultats selon la version de Pubmed utilisée), elle pose un problème essentiel pour la reproduction des requêtes conçues sous l’ancienne interface.

Autre difficulté, la prise en compte des dates de publication par Pubmed[2]. A l’aide du filtre de date disponible dans la colonne de filtre ou du code de champ [DP], Pubmed permet théoriquement de retrouver l’ensemble des références parues entre deux périodes données. Le champ [DP] de chaque référence est toutefois renseigné différemment selon les publications : seule l’indication de l’année est obligatoire. Tous les résultats dotés d’une date de publication « 2020 » peuvent ainsi être captés par une recherche portant sur janvier 2020, y compris si leur publication effective est postérieure. Cela ne permet pas de disposer de résultats fiables en recherchant des publications parues sur une période précise, autrement qu’en interrogeant le champ Date de publication par années entières.

La nouvelle version de Pubmed s’avère plus efficiente et plus ergonomique si votre objectif est de faire des recherches rapides, à la volée, pour trouver une ou plusieurs références sur un sujet précis. Dans le même temps, les évolutions de la base de données mettent en péril la reproductibilité des recherches, garantie de la qualité des revues systématiques et méta-analyses : à ce jour, la même recherche réalisée sur l’ancienne et la nouvelle version de Pubmed ne donnera pas les mêmes résultats, et il est parfois difficile de savoir comment Pubmed interprète une requête complexe. Dans un cas comme dans l’autre, ces transformations nous invitent à repenser nos usages de la base de données. D’autres modifications sont encore à prévoir, en particulier l’intégration de la base Mesh et des options de compte MyNCBI dans le nouveau Pubmed.

[1] A noter que la précédente version de Pubmed, « Pubmed legacy », est accessible jusqu’au 31 octobre à cette adresse.

[2] Voir à ce sujet García-Puente, María ; Pastor-Ramon, Elena ; Agirre, Oskia ; Morán, José-María ; Herrera-Peco, Iván (2020). « Research note. Open letter to the users of the new PubMed: a critical appraisal ». Profesional de la información, v. 29, n. 3, e290336. https://doi.org/10.3145/epi.2020.may.36

 

Bibliothécaires confinés mais connectés

Auteur biusantePublié le

Pendant le confinement, les bibliothécaires en télétravail d’Université de Paris restent à votre disposition. A la BIU Santé, une équipe est mobilisée  pour vous aider dans les domaines qui sont les siens : médecine, pharmacie, odontologie, soins infirmiers, kinésithérapie, bref toutes les disciplines médicales et paramédicales… mais aussi l’histoire de la santé, le droit de la  santé, etc.

Le service de questions / réponses de la BIU Santé, Biuminfo, est gratuit et ouvert à tous, praticiens comme particuliers, universitaires ou non, étudiants ou non : en somme, tous ceux qui ont besoin de l’aide des bibliothécaires. Grâce aux catalogues en ligne, aux bases de données, spécialisées, aux moteurs de recherche, nous pouvons prendre en charge vos questions.

A noter :  Biuminfo est un service assuré par des bibliothécaires, pas des médecins. Il ne s’agit en aucun cas d’une téléconsultation médicale.

Depuis le début du confinement, BiumInfo a répondu à plus de 50 questions.

Voici quelques exemples de questions, telles que formulées par les lecteurs, et auxquelles nous avons répondu récemment :

  • Je réalise des recherches sur Rhodiola rosea dans le cadre de ma thèse et je ne trouve pas d’article qui mentionne la description botanique de la plante. Auriez-vous des ressources à me proposer?
  • Le thème de mon mémoire est l’évaluation du ressenti du médecin qui prend en charge un autre médecin dans le cadre de la maladie grave et du soin palliatif.
  • J’aimerais avoir des renseignements sur ce qui est appelé « minimal brain damage » ou dommage minimal cérébral, en neurologie pédiatrique. Est-ce qu’elle n’existait que dans les années 1970 ?  Est-ce qu’on n’entend plus la même chose actuellement à ce sujet qu’auparavant ? Est-ce que cette notion revient à « la mode » ?
  • J’aurais besoin d’une bibliographie sur le sujet suivant : la cinétique et plus précisément la cinétique du dosage des chaînes légères libres dans le myélome multiple.
  • Je vous contacte au sujet d’un article que je me prépare à écrire sur un travail que j’ai effectué. Il s’agit de la création d’un outil d’aide à la décision médicale partagée portant sur les infections urinaires basses simples (cystites simple) et permet de discuter avec les patientes de la prescription ou non d’antibiotique. J’aurais voulu avoir votre avis sur les revues qui seraient intéressées par le sujet selon vous. Notre objectif est de viser des revues internationales en anglais, avec un IF > 1
  • J’aimerais savoir si dans les années 1860, la médecine légale était en mesure de déterminer à partir de son cadavre si une femme avait eu des enfants.
  • Je fais une recherche sur un médecin neurologue qui a exercé quai Lamenais à Rennes en 1958, pouvez-vous me retrouver son nom ?
  • Pourriez-vous me préciser qui s’est présenté pour la chaire d’Histoire de la Médecine en 1911 ? Et quels en ont été (ou qui a été) titulaire(s) cette même année 1911 ?
  • J’aimerais savoir ce que l’on désignait par « avoir des clous » (au bras, à la jambe), au XVIIIeme siècle ? Est-ce accompagné de fièvre ? A quoi cela correspond-il ?
  • Je suis à la recherche d’informations médicales concernant Maurice VERDUN (1885-1968) notamment sur sa Thèse de Doctorat de Médecine, après des études médicales à Reims. Il a été interne de Paris (1908)  et après ? De même, avez-vous des informations concernant son cursus hospitalier ou des références concernant ses travaux scientifiques ultérieurs et ses publications
  • Je recherche la thèse de Christian Roudil soutenue à Rouen sous la présidence du Pr. Dailly Robert  dans les années fin 1960 début 1970

Mais nous n’avons pas toujours réponse à tout, et les questions suivantes sont restées sans réponse :

  • Can I order a reproduction (art print) of Leonardo da Vinci’s « Mona Lisa »?
  • J’ai une clinique et je veux qu’on travaille ensemble pour sauver la population.

Contactez-nous !

L’informateur médical, 1923 https://www.biusante.parisdescartes.fr/histmed/image?med100129x1923x0057

 

 

Publications de la Faculté de pharmacie (été 2019)

Auteur Noëmie RosembergPublié le

La BIU Santé vous propose un panorama des dernières publications (juin-septembre 2019) des chercheurs de la Faculté de pharmacie de Paris  disponibles dans nos bases de données.

Vous pouvez accéder à ces articles à distance via la BIU Santé (avec vos codes ENT pour les revues électroniques auxquelles nous sommes abonnés).

Si vous ne trouvez pas un article en ligne, adressez-vous à notre service Recherche. Les bibliothécaires peuvent également vous aider à rendre vos articles accessibles à tous via l’Open Access. Les publications citées ci-dessous, accessibles sur la plateforme HAL sont signalées par ce logo, cliquable :Exposition en ligne sur l'Open Access | BU Evry

Vous trouverez ci-dessous les dernières publications de la faculté, classées par structure de recherche puis par nom de premier auteur. N’hésitez pas à nous contacter en cas d’erreur ou d’omission.

  • UMR-S 1139 Physiopathologie et pharmacotoxicologie placentaire humaine
  • UMR-S 1140 Innovations thérapeutiques en hémostase
  • UMR-S 1144 Optimisation thérapeutique en neuropsychopharmacologie
  • UMR 8258 Inserm U1022 Unité de Technologies Chimiques et Biologiques pour la Santé (UTCBS)
  • UMR 8038 CiTCoM Cibles Thérapeutiques et Conception de Médicaments
  • UMR 216 Mère et enfant en milieu tropical : pathogènes, système de santé et transition épidémiologique
  • EA 4466 Prévention et traitement de la perte protéique musculaire en situation de résistance à l’anabolisme
  • EA 7537 Biostatistique, traitement et modélisation des données biologiques
  • UMS 3612 Plates-formes mutualisées du centre de recherche pharmaceutique de Paris
  • EA 4064 Epidémiologie environnementale : impact sanitaire des pollutions
  • EA 4065 Ecosystème intestinal, probiotiques, antibiotiques
  • EA 4475 Pharmacologie de la circulation cérébrale
  • EA 7331 Génétique, physiopathologie et approches thérapeutiques des maladies héréditaires du système nerveux
  • UMR 8015 Laboratoire de cristallographie et RMN biologiques
  • UMR 8601 Laboratoire de Chimie et de Biochimie Pharmacologiques et Toxicologiques
  • UMR 8638 Chimie organique médicinale et extractive et toxicologie expérimentale
  • UMR-S 1007 Homéostasie Cellulaire et Cancer
  • UMR-S 1124 Pharmacologie, Toxicologie et Signalisation cellulaire
  • UMR-S 1147 Médecine Personnalisée, Pharmacogénomique, Optimisation Thérapeutique
  • FR 3567 CICB-Paris Centre Interdisciplinaire Chimie Biologie

UMR-S 1139 Physiopathologie et pharmacotoxicologie placentaire humaine

Buchrieser J., Degrelle S.A., Couderc T., Nevers Q., Disson O., Manet C., Donahue D.A., et al. 2019. « IFITM Proteins Inhibit Placental Syncytiotrophoblast Formation and Promote Fetal Demise ». Science 365 (6449): 176‑80. https://doi.org/10.1126/science.aaw7733.

Campeotto F., Hospital V., et Maigret P. 2019. « Prevalence and Management of Functional Gastrointestinal Disorders in French Infants-the Rome Study in France ». Journal of Pediatric Gastroenterology and Nutrition 68: 394. https://doi.org/10.1097/MPG.0000000000002403.

Camperi J., De Cock B., Pichon V., Combes A., Guibourdenche J., Fournier T., Vander Heyden Y., Mangelings D., et Delaunay N. 2019. « First Characterizations by Capillary Electrophoresis of Human Chorionic Gonadotropin at the Intact Level ». Talanta 193: 77‑86. https://doi.org/10.1016/j.talanta.2018.09.095.

Camperi J., Pichon V., Fournier T., et Delaunay N. 2019. « First Profiling in Hydrophilic Interaction Liquid Chromatography of Intact Human Chorionic Gonadotropin Isoforms ». Journal of Pharmaceutical and Biomedical Analysis 174: 495‑99. https://doi.org/10.1016/j.jpba.2019.06.014.

Hue I., Dufort I., Carvalho A.V., Laloe D., Peynot N., Degrelle S.A., Viebahn C., et Sirard M.-A. 2019. « Different Pre-Implantation Phenotypes of Bovine Blastocysts Produced in Vitro ». Reproduction 157 (2): 163‑78. https://doi.org/10.1530/REP-18-0439.

Richard C., Degrelle S., Gelin V., Neveux A., Chavatte-Palmer P., Heyman Y., et Hue I. 2019. « Elongation of Trophoblastic Vesicles between Days 15 and 18 in Cattle ». Reproduction, Fertility and Development 31 (1): 168. https://doi.org/10.1071/RDv31n1ab85.

Velasquez J.C., Zhao Q., Chan Y., Galindo L.C.M., Simasotchi C., Wu D., Hou Z., et al. 2019. « In Utero Exposure to Citalopram Mitigates Maternal Stress Effects on Fetal Brain Development ». ACS Chemical Neuroscience (In process). https://doi.org/10.1021/acschemneuro.9b00180.

UMR-S 1140 Innovations thérapeutiques en hémostase

Abdennour L., Sourour N., Drir M., Premat K., Shotar E., Taylor G., Godier A., et al. 2019. « Preliminary Experience with Cangrelor for Endovascular Treatment of Challenging Intracranial Aneurysms ». Clinical Neuroradiology (Article in Press). https://doi.org/10.1007/s00062-019-00811-2.

Almasi, Gabor Andras, Bengt Friman, Kenji Morita, et Krzysztof Redlich. 2019. « Fourier coefficients of the net baryon number density and their scaling properties near a phase transition ». PHYSICS LETTERS B 793 (juin): 19‑25. https://doi.org/10.1016/j.physletb.2019.04.023.

Al-Rifai R., Nguyen P., Bouland N., Terryn C., Kanagaratnam L., Poitevin G., François C., Boisson-Vidal C., Sevestre M.-A., et Tournois C. 2019. « In Vivo Efficacy of Endothelial Growth Medium Stimulated Mesenchymal Stem Cells Derived from Patients with Critical Limb Ischemia ». Journal of Translational Medicine 17 (1). https://doi.org/10.1186/s12967-019-2003-3.

Barco S., Russo M., Vicaut E., Becattini C., Bertoletti L., Beyer-Westendorf J., Bouvaist H., et al. 2019. « Incomplete Echocardiographic Recovery at 6 Months Predicts Long-Term Sequelae after Intermediate-Risk Pulmonary Embolism. A Post-Hoc Analysis of the Pulmonary Embolism Thrombolysis (PEITHO) Trial ». Clinical Research in Cardiology 108 (7): 772‑78. https://doi.org/10.1007/s00392-018-1405-1.

Blandinières, A., T. Gille, J. Sadoine, I. Bièche, L. Slimani, B. Dizier, P. Gaussem, et al. 2019. « Les progéniteurs endothéliaux circulants ne participent pas à la fibrogenèse dans le modèle de fibrose pulmonaire induite par la bléomycine chez la souris Nude ». Revue des Maladies Respiratoires, 23e Congrès de Pneumologie de Langue Française, 36 (janvier): A50‑51. https://doi.org/10.1016/j.rmr.2018.10.093.

Decouture B., Leuci A., Dizier B., Belleville-Rolland T., Mansour A., Martin F., Pidard D., Gaussem P., et Bachelot-Loza C. 2019. « Evaluation of Commonly Used Tests to Measure the Effect of Single-Dose Aspirin on Mouse Hemostasis ». Prostaglandins Leukotrienes and Essential Fatty Acids 149: 46‑51. https://doi.org/10.1016/j.plefa.2019.08.002.

Delrue M., Stepanian A., Camoin-Jau L., Chevillard L., Dragoni A., Megarbane B., et Siguret V. 2019. « Pharmacokinetics of Direct Oral Anticoagulants in Overdose in Self-Poisoned Patients Admitted to the Intensive Care Unit: A Bi-Center Observational Study ». Research and Practice in Thrombosis and Haemostasis 3: 804. https://doi.org/10.1002/rth2.12229.

Foulon G., Jourdi G., Cavalié C., Gouin-Thibault I., Pautas E., Gaussem P., Curis E., et Siguret V. 2019. « Effect of Dabigatran in the Very Elderly on Thrombinography and Fibrinography Parameters as Assessed with the Thrombodynamics® System ». Research and Practice in Thrombosis and Haemostasis 3: 131. https://doi.org/10.1002/rth2.12229.

Foulon G., Jourdi G., Pautas E., Lafuente-Lafuente C., Paris G., Le Guen J., Cavalie C., et al. 2019. « High Variability in Rivaroxaban and Apixaban Pharmacokinetics (PK) and Pharmacodynamics (PD) Assessed with Thrombin Generation in Patients over 80 Years ». Research and Practice in Thrombosis and Haemostasis 3: 151‑52. https://doi.org/10.1002/rth2.12229.

Gendron N., Billoir P., Gay J., Tuffigo M., Faille D., Ladhari C., De Raucourt E., et al. 2019. « Idarucizumab for Dabigatran Reversal in Clinical Practice: A French Retrospective Study of 41 Cases ». Research and Practice in Thrombosis and Haemostasis 3: 470. https://doi.org/10.1002/rth2.12229.

Giorni, Chiara, Chiara Pezzella, Mirela Bojan, Zaccaria Ricci, Philippe Pouard, Olivier Raisky, Laurent Tourneur, et al. 2019. « Impact of Heparin- or Nonheparin-Coated Circuits on Platelet Function in Pediatric Cardiac Surgery ». ANNALS OF THORACIC SURGERY 107 (4): 1241‑47. https://doi.org/10.1016/j.athoracsur.2018.09.032.

Jourdi G., Stepanian A., Foulon G., Mine L., Demagny J., Valaize J., Borgel A., et al. 2019. « Activated Charcoal for Lupus Anticoagulant Diagnosis in Patients Treated with Direct Oral Anticoagulants: Results of a Multicenter Study ». Research and Practice in Thrombosis and Haemostasis 3: 162. https://doi.org/10.1002/rth2.12229.

Klok F.A., Presles E., Tromeur C., Barco S., Konstantinides S.V., Sanchez O., Pernod G., et al. 2019. « Evaluation of the Predictive Value of the Bleeding Prediction Score VTE-BLEED for Recurrent Venous Thromboembolism ». Research and Practice in Thrombosis and Haemostasis 3 (3): 364‑71. https://doi.org/10.1002/rth2.12214.

Mahé I., Parent F., et Sanchez O. 2019. « What Are the Special Features of the Treatment of Venous Thombo-Embolic Disease in the Course of Pregnancy and Post-Partum? » Revue Des Maladies Respiratoires (Article in Press). https://doi.org/10.1016/j.rmr.2019.05.012.

Martin A., Siegal D., Verbrugge F., Fiarresga A., Camm J., Pieper K., Fox K.K.A., et al. 2019. « Why Do Clinicians Withhold Anticoagulation in Patients with Atrial Fibrillation and CHA2DS2-VASc Score ≥ 2? » Archives of Cardiovascular Diseases Supplements 11 (1): 83‑84. https://doi.org/10.1016/j.acvdsp.2018.10.184.

Martin A.C., Mahir Z., Crowley M., Dowling T., Breen K., Collings V., Hunt B., Moore G., Thomas W., et Cohen A.T. 2019. « DOAC Plasma Concentrations in High Weight Patients: An Observational Study ». Research and Practice in Thrombosis and Haemostasis 3: 218‑19. https://doi.org/10.1002/rth2.12227.

Mena H.A., Zubiry P.R., Dizier B., Schattner M., Boisson-Vidal C., et Negrotto S. 2019. « Ceramide 1 Phosphate Is a Potent Chemoattractant Factor of Endothelial Colony Forming Cells and Improve Post Ischemia Tissue Regeneration ». Research and Practice in Thrombosis and Haemostasis 3: 133‑34. https://doi.org/10.1002/rth2.12227.

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UMS 3612 Plates-formes mutualisées du centre de recherche pharmaceutique de Paris

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EA 4064 Epidémiologie environnementale : impact sanitaire des pollutions

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UMR-S 1147 Médecine Personnalisée, Pharmacogénomique, Optimisation Thérapeutique

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FR 3567 CICB-Paris Centre Interdisciplinaire Chimie Biologie

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Merci à Quentin Auffret pour la mise en place de cette veille bibliographique.

Nouvelles publications à la Faculté de Pharmacie de Paris (mai 2019)

Auteur biusantePublié le

Comme tous les mois, la BIU Santé vous propose un rapide panorama des dernières publications des chercheurs de la Faculté de pharmacie de Paris (mai 2019).

Vous pouvez accéder à ces articles à distance via la BIU Santé (avec vos codes ENT pour les revues électroniques auxquelles nous sommes abonnés).

Si vous ne trouvez pas un article en ligne, adressez-vous à notre service Recherche. Les bibliothécaires peuvent également vous aider à rendre vos articles accessibles à tous via l’Open Access.

Vous trouverez ci-dessous les dernières publications de la faculté, classées par structure de recherche puis par nom de premier auteur. N’hésitez pas à nous contacter en cas d’erreur ou d’omission.

  • UMR 216 MERIT Mère et enfant face aux infections tropicales
  • UMR-S 1139 Physiopathologie et pharmacotoxicologie placentaire humaine
  • UMR-S 1140 Innovations thérapeutiques en hémostase
  • UMR-S 1144 Variabilité de réponse aux psychotropes
  • UMR-S 1147 Médecine Personnalisée, Pharmacogénomique, Optimisation Thérapeutique
  • UMR 8015 Laboratoire de cristallographie et RMN biologiques
  • UMR 8258 – Inserm U1022 Unité de Technologies Chimiques et Biologiques pour la Santé (UTCBS)
  • UMR 8601 Laboratoire de Chimie et de Biochimie Pharmacologiques et Toxicologiques
  • UMR 8638 Chimie organique médicinale et extractive et toxicologie expérimentale

UMR 216 MERIT Mère et enfant face aux infections tropicales

  • Adamou, R., Dechavanne, C., Sadissou, I., d’Almeida, T., Bouraima, A., Sonon, P., Amoussa, R., Cottrell, G., Le Port, A., Theisen, M., Remarque, E.J., Longacre, S., Moutairou, K., Massougbodji, A., Luty, A.J.F., Nuel, G., Migot-Nabias, F., Sanni, A., Garcia, A., Milet, J., Courtin, D., 2019. Plasmodium falciparum merozoite surface antigen-specific cytophilic IgG and control of malaria infection in a Beninese birth cohort. Malar. J. 18, 194. https://doi.org/10.1186/s12936-019-2831-x
  • Joste, V., Maurice, L., Bertin, G.I., Aubouy, A., Boumédiène, F., Houzé, S., Ajzenberg, D., Argy, N., Massougbodji, A., Dossou-Dagba, I., Alao, M.J., Cot, M., Deloron, P., Faucher, J.-F., NeuroCM group, 2019. Identification of Plasmodium falciparum and host factors associated with cerebral malaria: description of the protocol for a prospective, case-control study in Benin (NeuroCM). BMJ Open 9, e027378. https://doi.org/10.1136/bmjopen-2018-027378
  • Schwoebel, V., Chiang, C.-Y., Trébucq, A., Piubello, A., Aït-Khaled, N., Koura, K.G., Heldal, E., Van Deun, A., Rieder, H.L., 2019. Outcome definitions for multidrug-resistant tuberculosis treated with shorter treatment regimens. Int. J. Tuberc. Lung Dis. 23, 619–624. https://doi.org/10.5588/ijtld.18.0798
  • Sissoko, A., Houze, S., Duval, R., 2018. Synthesis, chemical and biological validation of artemisinin-based probes for artemisinin’s derivatives antiparasitic mechanism of action study in plasmodium falciparum. Am. J. Trop. Med. Hyg. 99, 84–84.
  • Tornyigah, B., Dossou, A., Escriou, G., Nielsen, M., Salanti, A., Issifou, S., Massougbodji, A., Chippaux, J.-P., Deloron, P., Ndam, N., 2018. Persistent Plasmodium Falciparum Infection in Non Pregnant Women Is a Risk Factor for Pregnancy-Associated Malaria. Am. J. Trop. Med. Hyg. 99, 328–328.

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Nouvelles publications à la Faculté de Pharmacie de Paris (avril 2019)

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Vous trouverez ci-dessous les dernières publications de la faculté, classées par structure de recherche puis par nom de premier auteur. N’hésitez pas à nous contacter en cas d’erreur ou d’omission.

  • UMR 216 MERIT Mère et enfant face aux infections tropicales
  • UMR-S 1124 Pharmacologie, Toxicologie et Signalisation cellulaire
  • UMR-S 1140 Innovations thérapeutiques en hémostase
  • UMR-S 1144 Variabilité de réponse aux psychotropes
  • UMR-S 1147 Médecine Personnalisée, Pharmacogénomique, Optimisation Thérapeutique
  • UMS 3612 CNRS – UMS Inserm – Plates-formes mutualisées du centre de recherche pharmaceutique de Paris (PM-CRP2)
  • EA 4466 Prévention et traitement de la perte protéique musculaire en situation de résistance à l’anabolisme
  • UMR 8015 Laboratoire de cristallographie et RMN biologiques
  • UMR 8258 – Inserm U1022 Unité de Technologies Chimiques et Biologiques pour la Santé (UTCBS)
  • UMR 8601 Laboratoire de Chimie et de Biochimie Pharmacologiques et Toxicologiques
  • UMR 8638 Chimie organique médicinale et extractive et toxicologie expérimentale

UMR 216 MERIT Mère et enfant face aux infections tropicales

  • Chauvet, M., Tétard, M., Cottrell, G., Aussenac, F., Brossier, E., Denoyel, L., Hanny, M., Lohezic, M., Milet, J., Ndam, N.T., Pineau, D., Roman, J., Luty, A.J.F., Gamain, B., Migot-Nabias, F., Merckx, A., 2019. Impact of Hemoglobin S Trait on Cell Surface Antibody Recognition of Plasmodium falciparum-Infected Erythrocytes in Pregnancy-Associated Malaria. Open Forum Infect Dis 6, ofz156. https://doi.org/10.1093/ofid/ofz156
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  • Morio, F., Poirier, P., Le Govic, Y., Laude, A., Valot, S., Desoubeaux, G., Argy, N., Nourrisson, C., Pomares, C., Machouart, M., Dalle, F., Botterel, F., Bourgeois, N., Cateau, E., Leterrier, M., Beser, J., Lavergne, R.-A., Le Pape, P., 2019. Assessment of the first commercial multiplex PCR kit (ParaGENIE Crypto-Micro Real-Time PCR) for the detection of Cryptosporidium spp., Enterocytozoon bieneusi, and Encephalitozoon intestinalis from fecal samples. Diagnostic Microbiology and Infectious Disease. https://doi.org/10.1016/j.diagmicrobio.2019.04.004
  • Torcel-Pagnon, L., Bauchau, V., Mahy, P., Tin Tin Htar, M., van der Sande, M., Mahé, C., Krause, T.G., Charrat, A., Simondon, F., Kurz, X., ADVANCE Consortium, 2019. Guidance for the governance of public-private collaborations in vaccine post-marketing settings in Europe. Vaccine. https://doi.org/10.1016/j.vaccine.2019.04.073

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Nouvelles publications à la Faculté de Pharmacie de Paris (mars 2019)

Auteur biusantePublié le

Comme tous les mois, la BIU Santé vous propose un rapide panorama des dernières publications des chercheurs de la Faculté de pharmacie de Paris (mars 2019).

Vous pouvez accéder à ces articles à distance via la BIU Santé (avec vos codes ENT pour les revues électroniques auxquelles nous sommes abonnés).

Si vous ne trouvez pas un article en ligne, adressez-vous à notre service Recherche. Les bibliothécaires peuvent également vous aider à rendre vos articles accessibles à tous via l’Open Access.

Vous trouverez ci-dessous les dernières publications de la faculté, classées par structure de recherche puis par nom de premier auteur. N’hésitez pas à nous contacter en cas d’erreur ou d’omission.

  • UMR 216 MERIT Mère et enfant face aux infections tropicales
  • UMR-S 1124 Pharmacologie, Toxicologie et Signalisation cellulaire
  • UMR-S 1139 Physiopathologie et pharmacotoxicologie placentaire humaine
  • UMR-S 1140 Innovations thérapeutiques en hémostase
  • UMR-S 1144 Variabilité de réponse aux psychotropes
  • UMR-S 1147 Médecine Personnalisée, Pharmacogénomique, Optimisation Thérapeutique
  • EA 4064 Epidémiologie environnementale : impact sanitaire des pollutions
  • EA 4065 Ecosystème intestinal, probiotiques, antibiotiques
  • EA 4466 Prévention et traitement de la perte protéique musculaire en situation de résistance à l’anabolisme
  • UMR 8015 Laboratoire de cristallographie et RMN biologiques
  • UMR 8258 – Inserm U1022 Unité de Technologies Chimiques et Biologiques pour la Santé (UTCBS)
  • UMR 8601 Laboratoire de Chimie et de Biochimie Pharmacologiques et Toxicologiques
  • UMR 8638 Chimie organique médicinale et extractive et toxicologie expérimentale

UMR 216 MERIT Mère et enfant face aux infections tropicales

  • Agbota, G., Bodeau-Livinec, F., Accrombessi, M., Ahouayito, U., Fievet, N., Cot, M., Briand, V., 2018. Maternal nutritional status before and during pregnancy and child’s early neurocognitive development. Eur. J. Public Health 28, 242–242. https://academic.oup.com/eurpub/article/28/suppl_4/cky213.708/5192388
  • Lima, T.H.A., Souza, A.S., Porto, I.O.P., Paz, M.A., Veiga-Castelli, L.C., Oliveira, M.L.G., Donadi, E.A., Meyer, D., Sabbagh, A., Mendes-Junior, C.T., Castelli, E.C., 2019. HLA-A promoter, coding, and 3 ’ UTR sequences in a Brazilian cohort, and their evolutionary aspects. HLA 93, 65–79. https://doi.org/10.1111/tan.13474

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Nouvelles publications à la Faculté de Pharmacie de Paris (février 2019)

Auteur biusantePublié le

Comme tous les mois, la BIU Santé vous propose un rapide panorama des dernières publications des chercheurs de la Faculté de pharmacie de Paris (février 2019).

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Vous trouverez ci-dessous les dernières publications de la faculté, classées par structure de recherche puis par nom de premier auteur. N’hésitez pas à nous contacter en cas d’erreur ou d’omission.

  • UMR 216 MERIT Mère et enfant face aux infections tropicales
  • UMR-S 1124 Pharmacologie, Toxicologie et Signalisation cellulaire
  • UMR-S 1139 Physiopathologie et pharmacotoxicologie placentaire humaine
  • UMR-S 1140 Innovations thérapeutiques en hémostase
  • UMR-S 1144 Variabilité de réponse aux psychotropes
  • UMR-S 1147 Médecine Personnalisée, Pharmacogénomique, Optimisation Thérapeutique
  • EA 4064 Epidémiologie environnementale : impact sanitaire des pollutions
  • EA 4065 Ecosystème intestinal, probiotiques, antibiotiques
  • EA 4475 Pharmacologie de la circulation cérébrale
  • EA 7324 NF-kappaB, différentiation et cancer
  • UMR 8601 Laboratoire de Chimie et de Biochimie Pharmacologiques et Toxicologiques
  • UMR 8638 Chimie organique médicinale et extractive et toxicologie expérimentale

UMR 216 MERIT Mère et enfant face aux infections tropicales

  • Bodeau-Livinec, F., Davidson, L.L., Zoumenou, R., Massougbodji, A., Cot, M., Boivin, M.J., 2019. Neurocognitive testing in West African children 3–6 years of age: Challenges and implications for data analyses. Brain Research Bulletin 145, 129–135. https://doi.org/10.1016/j.brainresbull.2018.04.001
  • Harries, A.D., Schwoebel, V., Monedero-Recuero, I., Aung, T.K., Chadha, S., Chiang, C.-Y., Conradie, F., Dongo, J.-P., Heldal, E., Jensen, P., Nyengele, J.P.K., Koura, K.G., Kumar, A.M.V., Lin, Y., Mlilo, N., Nakanwagi-Mukwaya, A., Ncube, R.T., Nyinoburyo, R., Oo, N.L., Patel, L.N., Piubello, A., Rusen, I.D., Sanda, T., Satyanarayana, S., Syed, I., Thu, A.S., Tonsing, J., Trébucq, A., Zamora, V., Zishiri, C., Hinderaker, S.G., Aït-Khaled, N., Roggi, A., Caminero Luna, J., Graham, S.M., Dlodlo, R.A., Fujiwara, P.I., 2019. Challenges and opportunities to prevent tuberculosis in people living with HIV in low-income countries. Int. J. Tuberc. Lung Dis. 23, 241–251. https://doi.org/10.5588/ijtld.18.0207

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Enquête sur les pratiques de publication scientifique et d’Open Access

Auteur biusantePublié le

Le consortium Couperin lance une enquête auprès des chercheurs et enseignants-chercheurs des établissements de l’ESR membres de Couperin, sur leurs pratiques de publication scientifique et d’Open Access.

Accès à l’enquête

Cette enquête est menée dans le cadre du Plan national pour la science ouverte annoncé en juillet 2018, qui vise à généraliser l’accès ouvert aux publications et aux données issues des recherches financées sur fonds publics. Le plan français s’inscrit dans une dynamique européenne, avec le lancement en septembre 2018 du Plan S, porté notamment par Science Europe, et qui vise également à rendre disponibles en libre accès les publications des chercheurs dès 2020. Cette évolution a un impact direct sur le monde de l’édition scientifique et les critères d’évaluation.

Anonyme, l’enquête comprend quatre parties :
-A. la pratique dans les publications académiques,
-B. l’expérience des archives ouvertes,
-C. l’expérience des preprints,
-D. la perception des critères d’évaluation.

L’enquête sera clôturée le 8 mars 2019 et les résultats feront l’objet d’un rapport qui sera mis en ligne sur le site de Couperin.org, le site Open Access France, et sur celui d’Ouvrir la science du Comité de la Science Ouverte, chargé de la mise en œuvre du «Plan national pour la science ouverte».

L’enquête prend moins de 15 minutes, n’hésitez pas à faire circuler cette annonce à vos collègues.

Merci d’avance pour votre participation.

Nouvelles publications à la Faculté de Pharmacie de Paris (janvier 2019)

Auteur biusantePublié le

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  • UMR 216 MERIT Mère et enfant face aux infections tropicales
  • UMR-S 1007 Homéostasie Cellulaire et Cancer
  • UMR-S 1124 Pharmacologie, Toxicologie et Signalisation cellulaire
  • UMR-S 1139 Physiopathologie et pharmacotoxicologie placentaire humaine
  • UMR-S 1140 Innovations thérapeutiques en hémostase
  • UMR-S 1144 Variabilité de réponse aux psychotropes
  • UMR-S 1147 Médecine Personnalisée, Pharmacogénomique, Optimisation Thérapeutique
  • EA 4064 Epidémiologie environnementale : impact sanitaire des pollutions
  • EA 4065 Ecosystème intestinal, probiotiques, antibiotiques
  • EA 4475 Pharmacologie de la circulation cérébrale
  • EA 7331 Génétique, physiopathologie et approches thérapeutiques des maladies héréditaires du système nerveux
  • UMR 8015 Laboratoire de cristallographie et RMN biologiques
  • UMR 8258 – Inserm U1022 Unité de Technologies Chimiques et Biologiques pour la Santé (UTCBS)
  • UMR 8601 Laboratoire de Chimie et de Biochimie Pharmacologiques et Toxicologiques
  • UMR 8638 Chimie organique médicinale et extractive et toxicologie expérimentale

UMR 216 MERIT Mère et enfant face aux infections tropicales

  • Bancone, G., Menard, D., Khim, N., Kim, S., Canier, L., Nguong, C., Phommasone, K., Mayxay, M., Dittrich, S., Vongsouvath, M., Fievet, N., Le Hesran, J.-Y., Briand, V., Keomany, S., Newton, P.N., Gorsawun, G., Tardy, K., Chu, C.S., Rattanapalroj, O., Dong, L.T., Quang, H.H., Tam-Uyen, N., Thuy-Nhien, N., Hien, T.T., Kalnoky, M., Nosten, F., 2019. Molecular characterization and mapping of glucose-6-phosphate dehydrogenase (G6PD) mutations in the Greater Mekong Subregion. Malar. J. 18, 20. https://doi.org/10.1186/s12936-019-2652-y
  • Ndam, N.T., Tornyigah, B., Dossou, A.Y., Escriou, G., Nielsen, M.A., Salanti, A., Issifou, S., Massougbodji, A., Chippaux, J.-P., Deloron, P., 2018. Persistent Plasmodium falciparum Infection in Women With an Intent to Become Pregnant as a Risk Factor for Pregnancy-associated Malaria. Clin. Infect. Dis. 67, 1890–1896. https://doi.org/10.1093/cid/ciy380

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